Get HLA calls from MiDAS object.

getHlaCalls(object)

Arguments

object

MiDAS object.

Value

HLA calls data frame.

Examples

getHlaCalls(object = MiDAS_tut_object)
#>        ID      A_1      A_2       B_1      B_2      C_1      C_2     DPA1_1
#> 1    C001  A*25:01  A*26:01   B*07:02  B*18:01  C*12:03  C*07:02 DPA1*01:03
#> 2    C002  A*02:01 A*02:324   B*50:01  B*18:01  C*06:02  C*12:03 DPA1*01:03
#> 3    C003  A*24:02  A*24:04   B*46:01  B*40:06  C*01:03  C*15:02 DPA1*02:02
#> 4    C004  A*01:01  A*24:02   B*08:01  B*15:01  C*07:01  C*03:03 DPA1*01:03
#> 5    C005  A*01:01  A*25:01   B*18:01  B*08:01  C*12:03  C*07:01 DPA1*01:03
#> 6    C006  A*03:01  A*01:01   B*07:02  B*08:01  C*07:01  C*07:02 DPA1*01:03
#> 7    C007  A*01:01  A*02:01   B*15:01  B*08:01  C*07:01  C*03:03 DPA1*02:01
#> 8    C008  A*11:01  A*02:01   B*35:01  B*27:05  C*03:04  C*04:01 DPA1*01:03
#> 9    C009  A*23:01  A*01:01   B*13:02  B*18:01  C*07:01  C*07:02 DPA1*02:01
#> 10   C010  A*31:01  A*02:06   B*15:01  B*56:01  C*04:01  C*03:03 DPA1*02:02
#> 11   C011  A*02:01  A*01:01   B*07:02  B*13:02  C*06:02  C*07:02 DPA1*02:01
#> 12   C012  A*02:01  A*02:01   B*15:01  B*27:02  C*02:02  C*03:03 DPA1*01:03
#> 13   C013  A*02:05  A*01:01   B*49:01  B*57:01  C*07:01  C*07:01 DPA1*01:03
#> 14   C014  A*30:02  A*01:01   B*37:01  B*27:05  C*06:02  C*02:02 DPA1*02:01
#> 15   C015 A*02:642  A*03:01   B*07:02  B*07:02  C*07:02  C*07:02 DPA1*01:03
#> 16   C016  A*01:01  A*68:01   B*42:01 B*08:156  C*07:02  C*07:01 DPA1*01:03
#> 17   C017  A*03:01  A*11:01   B*08:01  B*18:01  C*05:01  C*07:01 DPA1*02:01
#> 18   C018  A*11:01  A*02:01   B*15:01  B*37:01  C*06:02  C*04:01 DPA1*01:03
#> 19   C019  A*02:10  A*31:01   B*54:01  B*40:06  C*08:01  C*01:02 DPA1*02:02
#> 20   C020  A*01:01  A*29:02   B*44:03  B*08:01  C*07:01  C*16:01 DPA1*02:01
#> 21   C021  A*11:01  A*02:01   B*18:01  B*44:02  C*07:01  C*05:01 DPA1*02:01
#> 22   C022  A*01:01  A*25:01   B*35:01  B*35:01  C*04:01  C*04:01 DPA1*01:03
#> 23   C023  A*24:02  A*30:02   B*44:02  B*18:01  C*05:01  C*05:01 DPA1*01:03
#> 24   C024  A*23:01  A*25:25   B*50:01  B*18:01  C*06:02  C*12:03 DPA1*01:03
#> 25   C025  A*26:01  A*33:03   B*40:01  B*38:01  C*12:03  C*03:04 DPA1*02:02
#> 26   C026  A*24:20  A*02:01   B*40:21 B*15:212  C*03:03  C*03:04 DPA1*02:01
#> 27   C027  A*02:01  A*02:01   B*44:02  B*18:01  C*05:01  C*05:01 DPA1*01:03
#> 28   C028  A*02:01  A*01:01   B*07:02  B*07:02  C*07:02  C*07:02 DPA1*02:01
#> 29   C029  A*03:01  A*03:01   B*38:01  B*14:01  C*08:02  C*12:03 DPA1*01:03
#> 30   C030  A*30:02  A*29:02   B*44:03  B*35:01  C*04:01  C*16:01 DPA1*02:01
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#> 32   C032  A*02:01  A*24:02   B*15:01  B*38:01  C*03:03  C*12:03 DPA1*01:03
#> 33   C033  A*01:01  A*02:01   B*08:01  B*13:02  C*07:01  C*06:02 DPA1*02:01
#> 34   C034  A*02:01  A*68:01   B*40:01  B*44:03  C*04:01  C*03:04 DPA1*01:03
#> 35   C035  A*02:01  A*01:01   B*15:01  B*44:02  C*05:01  C*03:04 DPA1*01:03
#> 36   C036  A*02:06  A*24:02   B*48:01  B*40:06  C*08:01  C*08:03 DPA1*01:03
#> 37   C037  A*01:01  A*01:01   B*07:02  B*13:02  C*06:02  C*07:02 DPA1*02:01
#> 38   C038  A*11:01  A*24:02   B*08:01  B*07:02  C*07:01  C*07:02 DPA1*01:03
#> 39   C039  A*02:01  A*30:02   B*37:01  B*18:01  C*06:02  C*05:01 DPA1*01:03
#> 40   C040  A*26:01  A*31:01   B*39:01  B*38:01  C*12:03  C*12:03 DPA1*01:03
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#> 43   C043  A*02:01  A*01:01   B*49:01  B*35:08  C*04:01  C*07:01 DPA1*01:03
#> 44   C044  A*24:02  A*26:01   B*40:02  B*13:02  C*06:02  C*01:02 DPA1*01:03
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#> 49   C049  A*24:02  A*33:03   B*44:03  B*52:01  C*14:03  C*12:02 DPA1*02:01
#> 50   C050  A*11:01  A*03:01   B*39:01  B*44:02  C*05:01  C*12:03 DPA1*01:03
#> 51   C051  A*29:02  A*23:01   B*37:01  B*44:03  C*06:02  C*04:01 DPA1*01:03
#> 52   C052  A*25:01  A*02:01   B*44:02  B*58:01  C*07:04  C*03:02 DPA1*01:03
#> 53   C053  A*02:01  A*02:01   B*13:02  B*49:01  C*06:02  C*07:01 DPA1*02:01
#> 54   C054  A*01:01  A*03:01   B*07:02  B*08:01  C*07:02  C*07:01 DPA1*01:03
#> 55   C055  A*24:02  A*01:01   B*39:01  B*35:08  C*12:03  C*04:01 DPA1*02:01
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#> 57   C057  A*11:01  A*03:02   B*35:01  B*40:02  C*04:01  C*02:02 DPA1*01:03
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#> 59   C059  A*11:01  A*24:02   B*35:03  B*44:02  C*04:01  C*05:01 DPA1*01:03
#> 60   C060  A*02:01  A*01:01   B*08:01  B*40:02  C*02:02  C*07:01 DPA1*01:03
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#> 89   C089  A*02:01  A*68:02   B*39:01  B*14:02  C*08:02  C*07:02 DPA1*01:03
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#> 104  C104  A*02:01  A*26:01   B*07:02  B*15:17  C*07:02  C*07:01 DPA1*02:01
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#> 995   DQB1*06:02 DRA*01:02 DRA*01:01 DRB1*15:01 DRB1*11:01
#> 996   DQB1*06:04 DRA*01:02 DRA*01:02 DRB1*13:03 DRB1*13:02
#> 997   DQB1*03:01 DRA*01:02 DRA*01:01 DRB1*04:04 DRB1*14:06
#> 998   DQB1*05:01 DRA*01:01 DRA*01:01 DRB1*07:01 DRB1*01:01
#> 999   DQB1*02:02 DRA*01:01 DRA*01:01 DRB1*04:01 DRB1*07:01
#> 1000  DQB1*05:01 DRA*01:01 DRA*01:02 DRB1*01:01 DRB1*03:01